普通PCR需要正反向引物各一條，即一對引物，有些特殊PCR需要多條引物。

pcr技術的基本原理類似于dna的自然復制過程，其特異性依賴于靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。

pcr是一種體外dna擴增技術，它依賴于dna聚合酶在模板dna、引物和四種脫氧核苷酸存在下的酶促反應。待擴增的DNA片段及其兩側互補的寡核苷酸鏈引物通過“高溫變性-低溫退火-引物延伸”三步反復循環，使DNA片段的數量成倍增加，因此在短時間內，我們需要大量的特異性基因片段。

在環境檢測中，靶核酸序列經常存在于細胞提取物等復雜混合物中，且含量非常低。對于檢測這種復雜群體中的特定微生物或基因，雜交是不敏感的。

pcr技術可以將目標序列擴增幾個數量級，然后用探針雜交檢測擴增序列，用于微生物種群結構的定性或定量分析。pcr技術常與rt-pcr、競爭pcr、巢式pcr、rapd、ardra等技術結合使用。