目前在食堂管理上存在最多的問題主要表現在以下幾個方面：

1、食品衛生安全管理問題。食品衛生安全出現問題，尤其是食物中毒問題，將會給食堂的經營者和管理者造成嚴重的損失，甚至涉及法律問題。

2、成本效益問題。食堂既不能讓經營者虧損，又不能讓管理者虧損，如何平衡成本和經濟效益問題，是他們都需要認真面對的問題。

3、食堂經營者即員工素質問題。由于食堂都有相對固定的消費者，沒有競爭或者競爭程度極低，導致了食堂經營者不注重自身素質及員工素質的提升，員工的流動率很大，從而導致服務質量低下。

4、食堂的監督約束問題。很多食堂缺乏有效的監督機制，致使食堂的經營者缺乏足夠的約束，采購、制作和銷售各個環節存在巨大的安全隱患，容易滋生腐敗和危險。

5、食堂經營者的激勵機制問題。食堂經營者往往缺乏足夠的改進和創新動力，食堂體現了所有者的運營管理水平，只有立足消費者的需求，以人為本，才能從根本上解決好問題。